説明しても君には分からないよ。

You wouldn't understand.

ここで「wouldn’t」と「仮定法」を使っていることで、「説明しない」ことを前提に話していますね。そして「You wouldn’t understand even if I explained.」の「even if I explained（もし説明しても）」の部分を言う必要は全くなくて、「wouldn’t」を使うだけで、そういう意味になります。仮定法はそういうことが多いですね。

たとえば「I would break up if I were you.（もし私だったら別れるね）」の「if I were you」を省略することが一般的ですね。

そして、告白されて「We wouldn’t work out.（付き合ったとしてもうまくいかないだろう）」と「if we went out（もし付き合っても）」を付けない、そして仮定法で言っているので「付き合わない」ことを前提に話していて、告白を断っていますね。